奥秘的EVA零号机驾驶员绫波丽，正在与碇元度商定之时，离开了NERV底层中心教条的白色池塘边。她的命运彷佛就将正在此竣事。　　正在求助紧急时刻，葛城美里不单要实现加持良治交代的对“第二次大难”实情和“人类补完方案”的探查事情，还要庇护碇真嗣与嫡香，和防范SEELE 对初号机与二号机的物理打仗。　　出于对碇元度的憎恶，赤木律子承受了SEELE引爆MAGI的提案，她可否乐成？长时间与SEELE同事的碇元度、冬月耕造、碇唯，为了避免人类“终极的惨剧”，而酝酿了的“人类补完方案”可否完成？尽正在《新世纪福音战士》影戏版第2部中解答。